Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM23P36406 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM23P36406 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms