Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms