Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MARCKSP29966 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCKSP29966 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSP29966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms