Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA1P27694 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA1P27694 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA1P27694 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA1P27694 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA1P27694 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA1P27694 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA1P27694 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA1P27694 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA1P27694 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPA1P27694 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPA1P27694 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPA1P27694 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA1P27694 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA1P27694 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA1P27694 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA1P27694 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA1P27694 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA1P27694 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA1P27694 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms