Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM3P25205 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM3P25205 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM3P25205 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM3P25205 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM3P25205 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM3P25205 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM3P25205 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM3P25205 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM3P25205 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM3P25205 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM3P25205 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM3P25205 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM3P25205 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM3P25205 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms