Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLRA1P23415 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GLRA1P23415 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLRA1P23415 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLRA1P23415 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GLRA1P23415 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GLRA1P23415 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLRA1P23415 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms