Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH3P22223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH3P22223 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH3P22223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH3P22223 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH3P22223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH3P22223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH3P22223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH3P22223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH3P22223 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH3P22223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH3P22223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH3P22223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH3P22223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms