Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TRHP20396 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRHP20396 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRHP20396 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRHP20396 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRHP20396 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRHP20396 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRHP20396 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRHP20396 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRHP20396 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRHP20396 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TRHP20396 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRHP20396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRHP20396 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRHP20396 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRHP20396 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRHP20396 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRHP20396 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRHP20396 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRHP20396 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRHP20396 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRHP20396 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRHP20396 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRHP20396 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRHP20396 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRHP20396 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRHP20396 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRHP20396 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRHP20396 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRHP20396 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRHP20396 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRHP20396 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRHP20396 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRHP20396 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRHP20396 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TRHP20396 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRHP20396 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRHP20396 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms