Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN8P19075 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms