Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG1P18858 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIG1P18858 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIG1P18858 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIG1P18858 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG1P18858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIG1P18858 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIG1P18858 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIG1P18858 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIG1P18858 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIG1P18858 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG1P18858 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG1P18858 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG1P18858 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms