Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms