Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FLT1P17948 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FLT1P17948 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FLT1P17948 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FLT1P17948 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FLT1P17948 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FLT1P17948 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FLT1P17948 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FLT1P17948 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FLT1P17948 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FLT1P17948 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FLT1P17948 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FLT1P17948 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FLT1P17948 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FLT1P17948 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FLT1P17948 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FLT1P17948 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FLT1P17948 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FLT1P17948 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FLT1P17948 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FLT1P17948 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FLT1P17948 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FLT1P17948 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms