Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMD1P17707 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMD1P17707 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMD1P17707 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMD1P17707 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMD1P17707 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMD1P17707 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMD1P17707 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMD1P17707 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMD1P17707 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMD1P17707 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMD1P17707 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMD1P17707 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMD1P17707 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMD1P17707 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMD1P17707 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMD1P17707 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms