Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF43P17038 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF43P17038 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms