Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSP16219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSP16219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSP16219 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSP16219 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSP16219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSP16219 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSP16219 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSP16219 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSP16219 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSP16219 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSP16219 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSP16219 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSP16219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSP16219 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSP16219 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSP16219 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSP16219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSP16219 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSP16219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSP16219 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSP16219 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSP16219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSP16219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSP16219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSP16219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSP16219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms