Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC130P13994 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC130P13994 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms