Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA4P13612 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA4P13612 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms