Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms