Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1P11387 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TOP1P11387 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1P11387 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1P11387 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1P11387 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1P11387 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1P11387 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1P11387 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1P11387 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1P11387 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1P11387 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1P11387 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1P11387 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOP1P11387 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1P11387 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1P11387 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1P11387 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1P11387 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1P11387 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms