Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTAP09496 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTAP09496 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTAP09496 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTAP09496 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTAP09496 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTAP09496 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTAP09496 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTAP09496 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTAP09496 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTAP09496 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTAP09496 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTAP09496 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTAP09496 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms