Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSLP07711 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSLP07711 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSLP07711 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSLP07711 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSLP07711 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTSLP07711 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSLP07711 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSLP07711 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSLP07711 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSLP07711 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms