Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAVP06756 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAVP06756 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms