Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFNA4P05014 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms