Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TK1P04183 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TK1P04183 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TK1P04183 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TK1P04183 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TK1P04183 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TK1P04183 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TK1P04183 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TK1P04183 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TK1P04183 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TK1P04183 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TK1P04183 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TK1P04183 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TK1P04183 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TK1P04183 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.7 ms