Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DRAP01903 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms