Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYF2O95926 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYF2O95926 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYF2O95926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYF2O95926 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYF2O95926 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYF2O95926 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYF2O95926 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYF2O95926 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms