Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD1O95696 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRD1O95696 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRD1O95696 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRD1O95696 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD1O95696 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD1O95696 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD1O95696 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD1O95696 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD1O95696 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD1O95696 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD1O95696 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD1O95696 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD1O95696 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRD1O95696 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRD1O95696 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRD1O95696 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD1O95696 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD1O95696 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD1O95696 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD1O95696 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms