Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms