Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL3O95573 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms