Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE4BO95155 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms