Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN2O75298 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN2O75298 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN2O75298 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN2O75298 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN2O75298 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN2O75298 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN2O75298 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms