Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms