Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PPLO60437 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PPLO60437 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PPLO60437 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PPLO60437 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PPLO60437 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PPLO60437 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPLO60437 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PPLO60437 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PPLO60437 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PPLO60437 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PPLO60437 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PPLO60437 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PPLO60437 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PPLO60437 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PPLO60437 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PPLO60437 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PPLO60437 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPLO60437 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPLO60437 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PPLO60437 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PPLO60437 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PPLO60437 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PPLO60437 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PPLO60437 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PPLO60437 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PPLO60437 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PPLO60437 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PPLO60437 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PPLO60437 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PPLO60437 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPLO60437 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PPLO60437 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PPLO60437 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PPLO60437 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPLO60437 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPLO60437 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms