Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BUD23O43709 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BUD23O43709 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BUD23O43709 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BUD23O43709 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BUD23O43709 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BUD23O43709 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BUD23O43709 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BUD23O43709 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BUD23O43709 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms