Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN4O43707 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms