Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2DO15514 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms