Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLGNO14967 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLGNO14967 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLGNO14967 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLGNO14967 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLGNO14967 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms