Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HIP1O00291 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIP1O00291 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIP1O00291 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIP1O00291 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIP1O00291 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIP1O00291 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIP1O00291 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIP1O00291 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIP1O00291 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HIP1O00291 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIP1O00291 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIP1O00291 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIP1O00291 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIP1O00291 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIP1O00291 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms