Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNAP23O00161 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms