Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
J3KR12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
J3KR12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
J3KR12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3KR12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3KR12 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3KR12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3KR12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3KR12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3KR12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3KR12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3KR12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3KR12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
J3KR12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3KR12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3KR12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3KR12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms