Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM23A6NLE4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms