Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187AA6NFU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187AA6NFU0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms