Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms