Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIPSLA2A3N6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms