Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F8A0AVK6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms