Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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