Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms