Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF7Q9UBF6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF7Q9UBF6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms