Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARRDC4Q8NCT1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARRDC4Q8NCT1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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