Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms